IMPLEMENTAÇÃO DE NOVOS TEMPLATES E DE UMA NOVA MATRIZ DE SUBSTITUIÇÃO PARA ATUALIZAÇÃO DO GASS-WEB

Resumo

O projeto de atualização do Genetic Active Site Search (GASS-WEB) representa um avanço significativo na pesquisa de identificação de sítios ativos e de ligação em proteínas. Ao incorporar as novas versões do M-CSA e do BioLip, bem como otimizar o servidor web, a equipe demonstrou um compromisso em manter o GASS-WEB relevante e eficaz para a comunidade científica. A metodologia empregada na atualização dos templates e na geração da matriz de substituição, baseada em informações do Carbono Alfa (CA) e Last Heavy Atom (LHA) de resíduos de aminoácidos, juntamente com a validação de mutações conservativas usando a matriz Blosum62, demonstra um rigor científico na seleção e atualização dos dados. Isso garante a precisão e a confiabilidade das buscas por sítios ativos e de ligação em proteínas. A implementação de uma rotina para eliminar resultados redundantes, melhorando a eficiência do algoritmo genético, é uma adição valiosa que aprimora a experiência do usuário e reduz a permutação de resíduos nos resultados obtidos. As melhorias na interface do usuário, com a eliminação de duplicações de sítios em cadeias diferentes e a introdução de uma nova página de visualização de resultados na estrutura proteica, tornam o GASS-WEB mais acessível e útil para os pesquisadores que desejam explorar os resultados de suas buscas de forma mais eficiente. No geral, as melhorias na metodologia, na base de dados e na interface do usuário garantem que o GASS-WEB continue a desempenhar um papel importante na pesquisa biomolecular e na descoberta de alvos terapêuticos.