Protcool: gerador de protocolos para simulações de docking e dinâmica molecular

Resumo

Ao final do período a que se refere este relatório, o sistema ProtCool está mais completo, com funcionalidades que entregam ao usuário uma experiência mais amigável. As análises sintática e semântica realizadas pelos dois primeiros scripts, auxiliam na coerência das simulações e dão um feedback mais preciso para o usuário em casos de erros nos arquivos de configuração. Dessa forma, o sistema é protegido contra erros passíveis de previsão. Os comparativos feitos com as poses geradas no Docking, serviram para comprovar o funcionamento do ProtCool e o EasyVS que já vem sendo utilizada há mais tempo. Os números obtidos servem como prova de que o ProtCool gera resultados consistentes. De modo geral, a pesquisa desenvolvida agregou significativa experiência de interdisciplinaridade. Tarefas tais como o desenvolvimento dos scripts de verificação que levaram meses para serem concluídos devido à complexidade e variedade de possibilidades. Durante esse período desenvolveram-se habilidades e conhecimentos em Python, manipulação de arquivos, expressões regulares, comandos do sistema Linux, parâmetros para docking e dinâmica molecular, entre outros.